代替ログインIDについて
オンプレADとEntra IDをEntra Connectで同期すると、オンプレADのUPN属性値が、Entra IDのUPN属性値にセットされます。Entra IDには、Entra IDのUPN属性値をユーザアカウントとして使いログインすることになるため、要は大元のオンプレADのUPN属性値をユーザアカウントとして使いEntra IDにログインしているということになります。
代替ログインIDというのは、オンプレADとEntra IDをEntra Connectで同期しているという状況下のおいて、オンプレADのUPN属性値をユーザアカウントとして使わずに、別の値を使用して、Entra IDにログインする方法のことです。
たとえば、オンプレADのドメインで「@test.local」のようなインターネットで名前解決できないドメインを利用していて、Entra ConnectでオンプレADのUPN属性を、Entra IDに同期してまうと、不都合が生じてしまう（Entra IDのUPN属性のUPNサフィックスは、インターネット上で名前解決できる必要があるため）ため、不都合を解消するための手段として代替ログインIDが用意されています。
Entra IDのUPN属性以外の別の値を利用する方法をMSは３つ提供しています。
代替ログイン ID としてメール アドレスを使用して Microsoft Entra ID にサインインする – Microsoft Entra ID | Microsoft Learn
①AD FSの代替ログインID
AD FSがオンプレにある環境で使えるやり方らしいです（具体的なところは私もよくわかっていない）
AD FSで設定した何かしらの値を、Entra IDのUPN属性にセットする方法だと認識しています
②Microsoft Entra Connectの代替ログインID
オンプレADユーザのUPN属性以外の属性（Mail属性など）のいずれかを指定し、その属性値を、Entra IDのUPN属性に上書きする方法です。
注意点
この構成は、Entra ハイブリッド参加は実現できません。
Entra ハイブリッド参加の条件としてオンプレAD側のUPNが、インターネット上で名前解決可能である必要があります。
この方法は、あくまでオンプレADユーザのUPN属性以外の属性を、Entra IDのUPN属性にセットする方法であり、オンプレADユーザのUPN属性値自体は、「@test.local」のままとなり、インターネット上で名前解決することができません。（オンプレUPN属性が「@test.co.jp」のようにインターネット上で名前解決することが可能なドメインである場合は、Entra ハイブリッド参加を実現できます）
この方法は、「IDの管理はオンプレADで実現したい」「Entra IDのUPNを、オンプレADのUPNと異なる値にしたい」という要件があった場合に有効です。（何度も言いますが、Entraハイブリッド参加できるかどうかは、オンプレADユーザのUPN属性が、インターネット上で名前解決できるか、否かに依存します）
代替UPNサフィックスが有用
- オンプレADユーザのUPN属性のUPNサフィックスは「@test.local」である
- Entra IDユーザのUPN属性は、オンプレADユーザのUPN属性とは異なる値をセットしたい（とうか、オンプレADユーザのUPN属性のUPNサフィックスが、インターネット上で名前解決できない値であるため、異なる値をセットする必要がある）
- IDの管理はオンプレADで実現したい
- Entra ハイブリッド参加を構成したい
上記要件があった場合、代替UPNサフィックスが有用です。
代替UPNサフィックスによって、オンプレADユーザのUPN（正確にはUPNサフィックス値）を、インターネット上で名前解決できるUPNサフィックス値（@test.co.jpなど）に変えてしまえばOKです。
これをすることで、Entra ハイブリッド参加の条件である、「オンプレAD側のUPNが、インターネット上で名前解決可能である必要がある」という条件もクリアできます。
③代替ログインIDとしてのメールアドレス
MSサポート曰く、②が何かしらの理由で使えないときに、使う最後の手段らしいです。
Entra IDにログインする際は、Entra IDユーザのUPN属性が、ユーザアカウントとして利用されるのですが、そもそも、ユーザアカウントとしてUPN属性を利用せずに、ProxyAddresses属性をユーザアカウントとして利用する方法です。（通常は、Entra IDログイン時にユーザアカウントとしてUPN属性にセットされている値を入力する必要があるが、ProxyAddress属性にセットされている値を入力することで、Entra IDへログインできるようにする方法）
ProxyAddresses属性には、オンプレADユーザのProxyAddress属性値がセットされます。